Das Institut für Informatik verfügt nicht nur über Universitäts-interne Forschungskooperationen, sondern kann auch eine große Menge nationaler Kooperationen mit akademischen Einrichtungen vorweisen.
Die Kooperationen werden von der "Technologiestiftung Schleswig-Holstein", von der "Deutschen Forschungsgemeinschaft", vom "Bundesminister für Bildung und Forschung" und von der "Europäischen Union" gefördert.

Darüber hinaus existiert eine Vielzahl internationaler Forschungskooperationen, wobei der Großteil dieser Beziehungen Europa betrifft. Die folgende Karte soll Ihnen einen kleinen Überblick über die internationalen Kooperationen des Instituts geben. Klicken Sie auf die Grafik, um diese in Originalgröße betrachten zu können.

Ein Kooperationsbeispiel ist das Zentrum für Numerische Simulation, an dem von Seiten des Instituts für Informatik die Arbeitsgruppen  Algorithmische optimale Steuerung - CO₂ Aufnahme des Meeres, Diskrete Optimierung und Scientific Computing beteiligt sind.

Im Rahmen der Exzellezinitiative der Bundesregierung ist die Arbeitsgruppe Algorithmische optimale Steuerung - CO₂ Aufnahme des Meeres unter der Leitung von Prof. Dr. Thomas Slawig am Instiut für Informatik angesiedelt und bearbeitet das Projekt A3 im Exzellenzcluster Ozean der Zukunft.